1. 古代宗庙中藏神主的石函。《左传·庄公十四年》“先君 桓公 命我先人，典司宗祏” 晋 杜预 注：“宗祏，宗庙中藏主石室。” 北魏 郦道元 《水经注·河水四》：“又东南逕 司马子长 墓北，墓前有庙，庙前有碑。 永嘉 四年， 汉阳 太守 殷济 瞻仰遗文，大其功德，遂建石室，立碑树桓。”《新唐书·礼乐志三》：“建石室於寝园，以藏神主，至禘祫之岁，则祭之。”
2. 指石造的墓室。《宋书·礼志二》：“ 汉 以后，天下送死奢靡，多作石室、石兽、碑铭等物。” 唐 杨炯 《为薛令祭刘少监文》：“石室兮沉沉， 蓬莱山 兮寂又阴。” 宋 叶适 《朱文昭母杨氏挽词》：“古今归石室，笔削纪萱堂。”
3. 泛指石造之室。比喻极坚固的防守设施。《三国志·吴志·贺邵传》：“近 刘氏 据三关之险，守重山之固，可谓金城石室，万世之业，任授失贤，一朝丧没，君臣係颈，共为羈僕。”
4. 古代藏图书档案处。《史记·太史公自序》：“ 周 道废， 秦 拨去古文，焚灭《诗》《书》，故明堂石室，金匱玉版，图籍散乱。” 晋 葛洪 《抱朴子·内篇自序》：“虽不足以藏名山石室，且欲缄之金匱，以示识者。” 南朝 梁 刘勰 《文心雕龙·史传》：“閲石室，啟金匱，抽裂帛，检残竹，欲其博练於稽古也。” 宋 司马光 《神宗皇帝挽辞》之二：“它年紬石室，光大继皇坟。” 清 钱谦益 《李自华父可守赠承德郎刑部山东清吏司主事制》：“为观於石室，视我赞书。”
5. 岩洞。 汉 赵晔 《吴越春秋·勾践入臣外传》：“ 吴王 知 范蠡 不可得为臣，谓曰：‘子既不移其志，吾復置子於石室之中。’ 范蠡 曰：‘臣请如命。’” 三国 魏 曹植 《苦思行》：“鬱鬱西岳巔，石室青青与天连。”《晋书·嵇康传》：“ 康 又遇 王烈 ，共入山……又於石室中见一卷素书，遽呼 康 往取，輒不復见。” 唐 于邺 《赠隐者》诗：“石室扫无尘，人寰与此分。” 宋 苏轼 《游桓山记》：“登 桓山 ，入石室。” 陈毅 《七星岩》诗：“石室叹钻天， 景福 祕地藏。”
6. 指传说中的神仙洞府。 汉 刘向 《真君传》：“ 赤松子 者， 神农 时雨师也……数往 崑崙山 中，常止 西王母 石室中，随风雨上下。” 晋 陶潜 《搜神后记》卷一：“ 始兴机山 东有两巖，相向如鴟尾。石室数十所。经过，皆闻有金石丝竹之响。”《剪灯新话·申阳洞记》：“更前百步，豁然开朗，见一石室，榜曰：申阳之洞。守门者数人，装束如昨夕庙中所睹。” 清 徐喈凤 《会仙记》：“ 秋鸿 以扇拂壁，忽豁大门，肃 丹忱 入。洞中石室，别有天地。” 黄侃 章炳麟 《游仙联句》：“石室坐 王母 ，旁揖 乔 松 儔。”